第1章：東京水圏／ヒト以前からの生態系
・器を規定する地下水系
・構造を規定する流水系
・水源としての雨水系
・気候を左右する海水系

第2章：エコヒストリー／水都の潮流
・先史／海進と海退
・上古／海道・川道と陸道・山道
・古代／平安海進と水都京都の誕生
・中世／寒冷化と動乱の水都
・近世／水都江戸
・現代／帝都東京と水都東京の変質

第3章：現未来から近未来へ／サバイバル
・現未来／地球時
・近未来／人新世